Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTGAGACAACATGGGCACTAACAGTTCTTGGTTACCTGGCAAAATTTGTTTTGGGAATTTTAGGgtaagctataatgtatgatgtataaatgtataatgaataatgttgctttgaactgttgtacatagttttacaaagattgcttactttaacaggtgttatgcttcttatctaacctaaaatttgaaaattgtaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G43020.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6914596|gb|AW396126.1|AW396126
EST:     GCACTAACAGTTCTTGGTTACCTGGCAAAATTTGTTTTGGGAATTTTAGG                         GTTGATTGTTTCAGTGGCATGGGTCGCTCATATTATTATCTACCTATTAAT
genomic: GCACTAACAGTTCTTGGTTACCTGGCAAAATTTGTTTTGGGAATTTTAGGgtaagctata ... attgtaacagGTTGATTGTTTCAGTGGCATGGGTCGCTCATATTATTATCTACCTATTAAT
EST: gi|22522977|gb|BU081788.1|BU081788
EST:     GCTCTAACAGTTCTTGGTTACCTGGCAAAATTTGTTTTGGGAATTTTAGG                         GTTGATTGTTTCAGTGGCGTGGGTCACTCATATAATTATCTACCTATTAAT
genomic: GCACTAACAGTTCTTGGTTACCTGGCAAAATTTGTTTTGGGAATTTTAGGgtaagctata ... attgtaacagGTTGATTGTTTCAGTGGCATGGGTCGCTCATATTATTATCTACCTATTAAT