Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CACTGATTCAGTAGTTCCTGTAACCGCGTCTCGGTATTCAATCCGTGCCTTGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgctacctttgaaaatgataccaattgaacatgttattattacttatttttttgcaattctattattatctatatgctgaggatcttttcttctatgaag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G26070.2
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|13240132|gb|BG359449.1|BG359449
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|58019406|gb|CX706148.1|CX706148
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|10846102|gb|BF069083.1|BF069083
EST:     CTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: CTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|10846445|gb|BF071337.1|BF071337
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAATTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACATTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|6726211|gb|AW310565.1|AW310565
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|51336355|gb|CO980221.1|CO980221
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|208305886|gb|GE109565.1|GE109565
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|27425429|gb|CA936949.1|CA936949
EST:     TGAACCTATTTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|15285283|gb|BI469174.1|BI469174
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
EST: gi|58016301|gb|CX703043.1|CX703043
EST:     TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAG                         GTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA
genomic: TGAACCTATCTACCATCATCAATTGGTACGCTTGGTATGATAATGACGAGgttggtgcta ... ttctatgaagGTTGGTGGCTGGAGTCAAGTTTATGAGGGGCTTACATTGGTTACAGTAAGA