1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GTTAATGAAGCTCGCTTGAGTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatatgcttctggctttatatgtttatttagtttaatctatttgcattttatatggaatgcttaaaatataatgaagtcttgagttctttgtggt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G06780.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|207819748|gb|GD790452.1|GD790452
genomic: CAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|208153506|gb|GD951423.1|GD951423
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: AGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|208240488|gb|GE040970.1|GE040970
genomic: AGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|193439503|gb|FK409892.1|FK409892
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: AAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|207787324|gb|GD756721.1|GD756721
genomic: AAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|208089303|gb|GD888636.1|GD888636
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|13562572|gb|BG550792.1|BG550792
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|51335938|gb|CO979804.1|CO979804
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|209723708|gb|BW682787.1|BW682787
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|192331880|gb|FK026664.1|FK026664
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGATGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGGGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTAEST: gi|209703691|gb|BW670681.1|BW670681
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
EST: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACT GTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
genomic: GTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatat ... ttttattcagGTTATGCGAAGATATGGTGTTCCTGAGCCTTATGAGAAGTTAAAAGAACTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTAATGAAGCTCGCTTGAGTGAAGACTTGAACCAGTGCTGGGAGGTGCTTGCTGAACCAATTCAGACTgtaagtatatgcttctggctttatatgtttatttagtttaatctatttgcattttatatggaatgcttaaaatataatgaagtcttgagttctttgtggt
- - - - - - - - - - TGAAGA