Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgataagaccaattacataacctcaacttgttactgaacttattatgcagtggagttggactaatttgctttgcacttgttctctttctgtttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G21310.2
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192315128|gb|FK009952.1|FK009952
EST:     ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAG                         CTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
genomic: ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgat ... tctgtttcagCTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
EST: gi|208156079|gb|GD952343.1|GD952343
EST:     ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAG                         CTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
genomic: ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgat ... tctgtttcagCTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
EST: gi|192317082|gb|FK007849.1|FK007849
EST:     ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAG                         CTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
genomic: ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgat ... tctgtttcagCTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
EST: gi|192317081|gb|FK007848.1|FK007848
EST:     ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAG                         CTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
genomic: ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgat ... tctgtttcagCTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
EST: gi|14126025|gb|BG790463.1|BG790463
EST:     ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAG                         CTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG
genomic: ATGATGTAGAGGCATGCAGTGCATGGTATTGGGTGCTTTTTGGCTTGCAGgttagatgat ... tctgtttcagCTTCCAATTGCACTTTTGGTGTTTGGCTATGAAGCAGTGAAGTTGTACAAG