Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTTATGTAGAGCATCTATTGGAGCCTCTATTACAGACAATTCTTGCTTTATCTGGACCAAGGACTACAACTATGgtaccttgttcaacttttctattaaattatgcactgatttttcatagtaaagttggataatttcacttatttcctattttattttgaatttataaatgaag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA11G19970.2
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192295995|gb|FG989403.1|FG989403
EST:     CTCTATTACAGACAATTCTTGCTTTATCTGGACCAAGGACTACAACTATG                         TTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCCATGAGAAGATGCTTCAGATG
genomic: CTCTATTACAGACAATTCTTGCTTTATCTGGACCAAGGACTACAACTATGgtaccttgtt ... ataaatgaagTTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCCATGAGAAGATGCTTCAGATG
EST: gi|192324407|gb|FK015758.1|FK015758
EST:     CTCTATTACAGACAATTCTTGCTTTATCTGGACCAAGGACTACAACTATG                         TTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCCATGAGAAGATGCTTCAGATG
genomic: CTCTATTACAGACAATTCTTGCTTTATCTGGACCAAGGACTACAACTATGgtaccttgtt ... ataaatgaagTTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCCATGAGAAGATGCTTCAGATG
EST: gi|213605231|gb|DB978719.1|DB978719
EST:     CTGGACCAAGGACTACAACTATG                         TTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCTATGAGAAGATGCTTCAGATG
genomic: CTGGACCAAGGACTACAACTATGgtaccttgtt ... ataaatgaagTTGGGGTATGAGATCCGCTCCACGAGTGTCCATGAGAAGATGCTTCAGATG