Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGGTAATGCAGATTATGCTATGGATATGCACCAGAAAGAACAACTTCATGACAATACTGTGCCAATGATGCAATCTCAGCATTTCTCTgtgggttacattttataaaagacaaaaaaatcttatctatatacatatccttttgtacaatatttgatggatcaaaacactgttcttctgaactttccatgctttctatctgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA11G15480.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA11G15480.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
lower sequence: Vv06s0004g03940.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
GTGGTAATGCAGATTATGCTATGGATATGCACCAGAAAGAACAACTTCATGACAATACTGTGCCAATGATGCAATCTCAGCATTTCTCTgtgggttacattttataaaagacaaaaaaatcttatctatatacatatccttttgtacaatatttgatggatcaaaacactgttctt----ctgaactttccatgctttctatctgcag
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |  || | |       | ||||  |    ||     |||| | || ||  ||  ||      |||  |   ||   ||    || |   |||| || ||||  |  ||||
GTGGTAATGCTGATTATGCTATGGATTTGCACCAGAAAGAACAATTTCATGACAATACTGTATCTATGATGCAATCTCAGCACTTCTCTgtgagtactagattttcagcttttgagaaattctga--atgcttctatcatattatattatgctttggatgtcatgaatttgcattttacccttatgcttccctg-tttcattgagcag