1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
CCTTCTGAATCTGTTGACCAATAATTATAAAAAAAGCATCAAGAAGGAAGCTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttacttgtttgttttatgataattaaacctccattttcacttgaagttcttattgcaataatattctcttcaattcctgataataagcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G29000.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAATEST: gi|19934371|gb|BQ079401.1|BQ079401
genomic: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
EST: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAA-TEST: gi|298166384|gb|HO010963.1|HO010963
genomic: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
EST: CATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAATEST: gi|19935944|gb|BQ080652.1|BQ080652
genomic: CATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
EST: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAATEST: gi|298172729|gb|HO019769.1|HO019769
genomic: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
EST: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAATEST: gi|19935942|gb|BQ080651.1|BQ080651
genomic: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
EST: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAG GCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
genomic: CTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttac ... taataagcagGCTGTGATTGAGGCTAATCTAATTGCTCCTTTGGTCAATCTGCTTCAAAAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCTTCTGAATCTGTTGACCAATAATTATAAAAAAAGCATCAAGAAGGAAGCTTGTTGGACCATATCAAACATCACAGCTGGTAATAAACAGCAGATTCAGgtatagttacttgtttgttttatgataattaaacctccattttcacttgaagttcttattgcaataatattctcttcaattcctgataataagcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT