Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GCTGCGGCAGCTAAAGGGGAAGCACCTCTTGGACTCCCTTTGAAAGGTGCTGGTCAAGATTCATCCGATGCACAACCAAGGgtaagccatacttattgaagtttacttttaattaacctcagggttgtttagttgtcatatataacatgattcttccaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G16620.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA08G16620.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
lower sequence: Vv04s0044g01210.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 6
GCTGCGGCAGCTAAAGGGGAAGCACCTCTTGGACTCCCTTTGAAAGGTGCTGGTCAAGATTCATCCGATGCACAACCAAGGgtaagccatacttattgaagtttacttttaattaacctcagggttgtttagttgtcatatataaca---tgattcttccaacag---
|| || || || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||  |   |  ||  ||||  |   || |  ||         ||   |||  ||   ||| ||| |   ||||| |  |   ||   
GCGGCTGCTGCAAAAGGAGAAGCTCCACCTGGACTCCCCTTGAAAGGTGCCGGCCAAGATTCATCAGACACACAACCAAAGgtggg---tgttttctgaaaatcttttgtgttttgttgtgtagtg--ttaaatgctgtatctaaaagattgattttatccctagcag