1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
CCCATGGTCGGTACTTGTCTAGGAATTTGCAACGAATTGTCAATGAGATTATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcactgttgttgccatcaacattctatcattattctttaaagaaaatatctttgcatttgcaattgtttttctattcaaagttgtggcattaaatctgtaagagtctgatatgtatattctgttgccag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G00570.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGAEST: gi|22931287|gb|BU548426.1|BU548426
genomic: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGA
EST: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGAEST: gi|9900815|gb|BE609783.1|BE609783
genomic: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGA
EST: ACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGEST: gi|23063971|gb|BU578744.1|BU578744
genomic: ACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAA-GACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGG
EST: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAEST: gi|208339552|gb|GE134484.1|GE134484
genomic: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAA
EST: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGAEST: gi|21601451|gb|BQ611782.1|BQ611782
genomic: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGA
EST: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGG AGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGA
genomic: ATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcact ... ctgttgccagAGAACTGCCTGAAGACGAATGGTTTAACGACATATGTCAAGATGCTATGGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCCATGGTCGGTACTTGTCTAGGAATTTGCAACGAATTGTCAATGAGATTATAACAAAAGCAATGGCAGCATTTTCTGCAACAGGGATGGATCCATATGGgtaggtcactgttgttgccatcaacattctatcattattctttaaagaaaatatctttgcatttgcaattgtttttctattcaaagttgtggcattaaatctgtaagagtctgatatgtatattctgttgccag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA