1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
TGGCGCAGCTGCCGTGGACATGTGTCATGTTGCATTGGGAATTGTAGAAGCTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttgagttttatatcattgataatgattctgactagtaagccttgaatctttgagactaaagtaatttttcctgaagagattatttgtctaatg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA06G25880.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTG ATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTTEST: gi|213587035|gb|DB982710.1|DB982710
genomic: CTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttg ... ccattcgtagATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTT
EST: TTATTGGGAATATCGTGC-AATTCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTG ATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTTEST: gi|51342073|gb|CO983339.1|CO983339
genomic: TTATTGGGAATATCGT-CTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttg ... ccattcgtagATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTT
EST: CTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTG ATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTTEST: gi|31466178|gb|CD408206.1|CD408206
genomic: CTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttg ... ccattcgtagATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTT
EST: GGCTGCTGGTGTTTTG ATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTT
genomic: GGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttg ... ccattcgtagATGGTTGAGGAAGCTGGTGGCACAGTTTCTCGGATGGATGGAGGAAAGTTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGGCGCAGCTGCCGTGGACATGTGTCATGTTGCATTGGGAATTGTAGAAGCTTATTGGGAATATCGTCTAAAGCCATGGGATATGGCTGCTGGTGTTTTGgtatgctttgagttttatatcattgataatgattctgactagtaagccttgaatctttgagactaaagtaatttttcctgaagagattatttgtctaatg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT