Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAAGGGCCTAACGTATTGAAGAAAATTGAAGAAGTGGGTGATGAAGAAGGGCATCCAACTGTAACAGTTAAAATCATTAATTGTGGTGAATATAGCGAGGgtgagaattactttttctatctttagaatacttagactttattcttaataagtatggtgaagattaaatcccaaattattttgctgagagttctgtctcc...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA04G07300.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208199576|gb|GD999887.1|GD999887
EST:     GCATCCAACTGTAACAGTTAAAATCATTAATTGTGGTGAATATAGCGAGG                         ATGGAAAGAAGGTAAAATAAAATACAAAAATGGGAAAGAATAAAA
genomic: GCATCCAACTGTAACAGTTAAAATCATTAATTGTGGTGAATATAGCGAGGgtgagaatta ... atacttgcagATGGAAAGAAGGTAAA-TAAA-T-CAAAAATGGGAAAGAATAAAA
EST: gi|151394687|gb|EV264558.1|EV264558
EST:     GCATCCAACTGTAACAGTTAAAATCATTAATTGTGGTGAATATAGCGAGG                         ATGGAAAGAAG-TAAATAAATC
genomic: GCATCCAACTGTAACAGTTAAAATCATTAATTGTGGTGAATATAGCGAGGgtgagaatta ... atacttgcagATGGAAAGAAGGTAAATAAATC