1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
CCAATGATATATGGCAGGGGTCCAATGCCAGCAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATgttctgtaagttggtacacctgatgtatatagtttcatttccttatatttgatataatgccttaatcttcatattgttgatatgttgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G42150.2 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATGTTCTEST: gi|213592623|gb|DB979414.1|DB979414
genomic: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTA-----Tgttctgtaag ... tatgtt
EST: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATGTTCTEST: gi|7591030|gb|AW706771.1|AW706771
genomic: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTA-----Tgttctgtaag ... tatgtt
EST: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTAT GEST: gi|7591030|gb|AW706771.1|AW706771
genomic: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATgttctgtaag ... tatgttgcag-
EST: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTAT G
genomic: CAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATgttctgtaag ... tatgttgcag-
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCAATGATATATGGCAGGGGTCCAATGCCAGCAGGAATGCAAATGGTTCCAATGATGTTACCAGATGGTCGAATTGGCTATgttctgtaagttggtacacctgatgtatatagtttcatttccttatatttgatataatgccttaatcttcatattgttgatatgttgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGATG