Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GACATGACCTCAGACCCTATTGGAGCATGCTACTGCCCTTCTCATATGCTGTAGTTTCAGGGGCTGTAGGTTCATGCTCAGTGTTGTTTGCTAAATCACTgtaagtcagctactccaacatgttgccatgcttcatgatacaatagccattgtgcctaatgtcaactttttggcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G07510.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA02G07510.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
lower sequence: Vv14s0068g00780.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
GACATGACCTCAGACCCTATTGGAGCATGCTACTGCCCTTCTCATATGCTGTAGTTTCAGGGGCTGTAGGTTCATGCTCAGTGTTGTTTGCTAAATCACTgtaagtcagctactccaacatgt-tgccatgcttcatga-----tacaatagcca---ttgtgcctaatgt-caactttttggcag------
|||| |||||    || || |||  |||||| || || || || ||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  | ||||       | | ||  ||| | || |      |   | ||| |   || | |||||| | ||  || ||| |        
GACAGGACCTTGAGCCTTACTGGCACATGCTGCTTCCATTTTCCTATGCTACAGTTTCAGGTGCCGTAGGATCATGCTCAGTGTTGTTCGCAAAATCTCTgtaagcaaactacattggtttttatgaaatggtgcaggtaaaattgtgaaagctacttttattcctaatatgcagtttcttgtcttgctcag