1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
GGGTATTGATTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcataagtatatttgcgacttagtgttaattttatttgatcaaattgaatattttaacataacactttgttctttatatataattttttaaaacaattgtcttcatatgaata
species | Glycine max |
transcript | GLYMA18G44820.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATANNNTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|192330118|gb|FK019773.1|FK019773
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|208254437|gb|GE054805.1|GE054805
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGTCTGGTCGTCCAATCEST: gi|192312271|gb|FK005275.1|FK005275
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGG-CTGGTCGTCCAATC
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|151412992|gb|EV282800.1|EV282800
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|213596908|gb|DB964115.1|DB964115
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|24206259|gb|BU965512.1|BU965512
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCTEST: gi|193388645|gb|FK357534.1|FK357534
genomic: TTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
EST: GTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATA GATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
genomic: GTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcata ... catatgaataGATACCCTATTATGACTCGGGCTTTAATGATGGCTGGTCGTCCAATCTTCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGGTATTGATTATTTGAAGTATGATAACTGTAACAATGATGGATCAAAACCAACTGATAggtagtcataagtatatttgcgacttagtgttaattttatttgatcaaattgaatattttaacataacactttgttctttatatataattttttaaaacaattgtcttcatatgaata
- - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA