Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGTGATTCTCTTTCCTTATTGCCTTCATCATTTACACCCCAAGATGCATCAAAAATGTTGTCCCTATGTCAATCTGTTCAAAATGCTCTTAAGgtgatacttaaccatgttgtagatttatgctcagtgtttttgattcatgtgttgataaactttattttctttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA11G15470.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254348097|gb|GR851776.1|GR851776
EST:     ATGCATCAAAAATGTTGTCCCTATGTCAATCTGTTCAAAATGCTCTTAAG                         TCTAACAAAGCACATATTTTTGGGGATTTTTATGTGTTGAGCAGCAGCTTT
genomic: ATGCATCAAAAATGTTGTCCCTATGTCAATCTGTTCAAAATGCTCTTAAGgtgatactta ... ttctttgcagTCTAACAAAGCACATATTTTTGGGGATTTTTATGTGTTGAGCAGCAGCTTT
EST: gi|15663582|gb|BI700953.1|BI700953
EST:     ATGCATCAAAAATGTTGTCCCTATGTCAATCTGTTCAAAATGCTCTTAAG                         TCTAACAAAGCACATATTTTTGGGGATTTTTATGTGTTGAGCAGCAGCTTT
genomic: ATGCATCAAAAATGTTGTCCCTATGTCAATCTGTTCAAAATGCTCTTAAGgtgatactta ... ttctttgcagTCTAACAAAGCACATATTTTTGGGGATTTTTATGTGTTGAGCAGCAGCTTT