1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
ATGACAGATGCCCGCTGCTCAAAATGTATGGATTGTAAGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctttttttactttagtccagagttccaaaactgtgtcctgcacttttatggcttggtttgattgcttggagctttgcctttacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G02560.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAG CTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTGEST: gi|208086371|gb|GD879433.1|GD879433
genomic: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctt ... gcctttacagCTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTG
EST: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAG CTGGAATGTGTT-CCTGTGGTCATTCCTGGTATGEST: gi|209710881|gb|BW653642.1|BW653642
genomic: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctt ... gcctttacagCTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATG
EST: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAG CTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTGEST: gi|7925555|gb|AW831590.1|AW831590
genomic: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctt ... gcctttacagCTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTG
EST: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAG CTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTGEST: gi|21993995|gb|BQ785523.1|BQ785523
genomic: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctt ... gcctttacagCTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTG
EST: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAG CTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTG
genomic: AGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctt ... gcctttacagCTGGAATGTGTTTCCTGTGGTCATTCCTGGTATGCCTCCCGGGATGAGGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATGACAGATGCCCGCTGCTCAAAATGTATGGATTGTAAGGTGGGCTTGAGAGAGATTATCCAAGCTGGAAATAATGAACGTTATCAGgtttcatctttttttactttagtccagagttccaaaactgtgtcctgcacttttatggcttggtttgattgcttggagctttgcctttacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA