Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAGgtgtggtgtatcatctttaatgaatgttattaataatttttagtcttagtatccatctattaaggttgccatattttattttttaaagcaattcctcttt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA11G02540.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207784428|gb|GD757283.1|GD757283
EST:     GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAG                         GTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC
genomic: GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAGgtgtggtgta ... tcctgtgcagGTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC
EST: gi|254328592|gb|GR832964.1|GR832964
EST:     GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAG                         GTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC
genomic: GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAGgtgtggtgta ... tcctgtgcagGTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC
EST: gi|208066190|gb|GD863987.1|GD863987
EST:     GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAG                         GTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC
genomic: GGCTTGCAAACATGCTTGGTTGCTCTTTTGTCCAGgtgtggtgta ... tcctgtgcagGTGGTTCAAGCATGCTGGAGAGTCATACATCAAAGTACCTTTCTTAGGAGC