Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTGTTTTGCGCATGATAAGCTTTGGATTCGATTTTCACTGGAGTAATCAAAATTCTCATTTTGATCAGGAGgtatgttttttgtttctgataatggtacttgttttgttttgaatataagattctactgtaaagtttctctcttaatttaatatggtttcatggatgacta...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G41940.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA10G41940.2 (Glycine max), 5'ss of exon 7
lower sequence: Vv00s0507g00020.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 1
TTGTTTTGCGCATGATAAGCTTTGGATTCGATTTTCACTGGAGTAATCAAAATTCTCATTTTGATCAGGAGgtatgttttttgtttctgataatggtacttgttttgttttgaatataag-attctactgtaaagtttctctcttaatttaatatggtttcatggatgacta
   ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||||   || || |  |||   |  | ||     ||| |||| |  |     |  | ||   || ||||  |  |||| || |     |  |   ||| | 
--ATTTTGCGCATGATAAGCTTTGGATATGATTACCACTGGGCTCATCAAGGTTCTCATTTTGATCAGAAGgtattcattctgctg-tgactttcatgctctgaatgtcttgagtgcatctgatggattgcttagattctggccaaattaaacaacagctggtttttgagtt