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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaatcagtatgacctatgatttataaatgtcagagacattatattgttatttagggcattaccaattgtcagtaaataattgacaattcacct...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G37760.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|57575920|gb|CX548891.1|CX548891
EST:     GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAG                         GGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
genomic: GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaa ... cttaatgcagGGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
EST: gi|58024590|gb|CX711331.1|CX711331
EST:     GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAG                         GGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
genomic: GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaa ... cttaatgcagGGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
EST: gi|58024332|gb|CX711073.1|CX711073
EST:     GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAG                         GGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
genomic: GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaa ... cttaatgcagGGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
EST: gi|192304811|gb|FG996027.1|FG996027
EST:     GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAG                         GGAGCAGCAACAACATGCCATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
genomic: GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaa ... cttaatgcagGGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
EST: gi|58021522|gb|CX708263.1|CX708263
EST:     GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAG                         GGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC
genomic: GTCTAATTAATGTGATTGGGAAACTGGTGCTTAAAAATGTCCAGCAGgtacgttgaa ... cttaatgcagGGAGCAGCAACAACATGCTATGTAGCATTGCACCCACAAGTGAAGGGAATC