1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GTACTTCCTCAATCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatgacttgaaagctggtcacttttatatgtatacatttagttgattcatcagtttcatgaatatgaatttttacctcttgtcactatgttgtcatttttccattatagcaaggattgggttagttagacaatagtcaggagttgtgatgtgtgctatttttaatgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G44410.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|31462046|gb|CD404074.1|CD404074
genomic: TCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|9565805|gb|BE475314.1|BE475314
genomic: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|10255339|gb|BE823105.1|BE823105
genomic: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|192294522|gb|FG987451.1|FG987451
genomic: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATEST: gi|208238442|gb|GE042680.1|GE042680
genomic: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGAT
EST: GAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|192306570|gb|FG997240.1|FG997240
genomic: GAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATCEST: gi|11274440|gb|BF324793.1|BF324793
genomic: TTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
EST: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATG CTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
genomic: TCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatg ... tttaatgcagCTGTAGATGATACACAACGTATGATGCAAATGGGTGGATTTGGATTTGATC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTACTTCCTCAATCTGTTTGGATTAAGAGGATTCTTTAGTCTCATCTTGGGTGAAGAAAATGgttagttatgacttgaaagctggtcacttttatatgtatacatttagttgattcatcagtttcatgaatatgaatttttacctcttgtcactatgttgtcatttttccattatagcaaggattgggttagttagacaatagtcaggagttgtgatgtgtgctatttttaatgcag
- - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA