Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATCATATGCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttcattttggtttgcggtttgcttaccataaattactatgtttacattgatataagcttatggtgattcatgttttttggtacatctaaaaca...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G14060.3
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA06G14060.3 (Glycine max), 5'ss of exon 7
lower sequence: Vv16s0098g01020.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 7
GATCATATGCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgta-aaccttcattttggtttgcggtttgcttaccataaattactatgtttacattgatataagctt---atggtgattcatgttttttggtacatctaaaaca
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||  |  |  | |     ||||  || || |      ||  |  |     | ||| |||  |||||   ||  ||||     |||| |  |||   ||     
GATCACATGCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAAGTTTCCCGTGATGCTGATGgtatgatttgtaatacttattgctattagcatttttctaaacatcaa----atattaataccagctttttattctgatgatcattttcttctactgttacgggg
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208155050|gb|GD956201.1|GD956201
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207808310|gb|GD777175.1|GD777175
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTGATTATGACGACATGAAGTATGCTA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCTA
EST: gi|5677805|gb|AI938935.1|AI938935
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193388580|gb|FK357469.1|FK357469
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACAATAGAAGTATGC
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACA-T-GAAGTATGC
EST: gi|193358175|gb|FK322757.1|FK322757
EST:     CGAAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: CG-AAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|14011762|gb|BG726684.1|BG726684
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208329235|gb|GE131233.1|GE131233
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193672715|gb|FK619799.1|FK619799
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGGTTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207718222|gb|GD698814.1|GD698814
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207809663|gb|GD782339.1|GD782339
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207718815|gb|GD700163.1|GD700163
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208148031|gb|GD949688.1|GD949688
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTACGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208152909|gb|GD945268.1|GD945268
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGCGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207703994|gb|GD684962.1|GD684962
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193443241|gb|FK405249.1|FK405249
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGAATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207769839|gb|GD742153.1|GD742153
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|31468970|gb|CD410998.1|CD410998
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193661822|gb|FK605240.1|FK605240
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208250928|gb|GE050051.1|GE050051
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|31311171|gb|CD396374.1|CD396374
EST:     TTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTGGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: TTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208305633|gb|GE109074.1|GE109074
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCTA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCTA
EST: gi|208095348|gb|GD892064.1|GD892064
EST:     GCGAAAAGCTGGTGACGTGTGCTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTG
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTG
EST: gi|208107067|gb|GD902908.1|GD902908
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193393546|gb|FK360644.1|FK360644
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCACTGTTGATTACACTAATTATGA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGA
EST: gi|193702518|gb|FK635184.1|FK635184
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193620835|gb|FK568503.1|FK568503
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193576540|gb|FK533679.1|FK533679
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGA
EST: gi|208096174|gb|GD891658.1|GD891658
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGACTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208307858|gb|GE105422.1|GE105422
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATATGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|10253540|gb|BE821306.1|BE821306
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208068554|gb|GD862736.1|GD862736
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208234156|gb|GE031015.1|GE031015
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193379789|gb|FK345347.1|FK345347
EST:     GCGAAAAGCTGGTGACGTGTGCTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCCA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCTA
EST: gi|23726789|gb|BU761397.1|BU761397
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193414754|gb|FK381394.1|FK381394
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193466946|gb|FK430337.1|FK430337
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTAGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208089216|gb|GD887051.1|GD887051
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193726924|gb|FK660250.1|FK660250
EST:     ATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: ATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208198398|gb|GD997589.1|GD997589
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATG
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATG
EST: gi|208049046|gb|GD845429.1|GD845429
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACA
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACA
EST: gi|207717122|gb|GD697616.1|GD697616
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|207713685|gb|GD695360.1|GD695360
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTAT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTAT
EST: gi|207814380|gb|GD786903.1|GD786903
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193589473|gb|FK544189.1|FK544189
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193553739|gb|FK509074.1|FK509074
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|193717067|gb|FK654695.1|FK654695
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208245893|gb|GE044779.1|GE044779
EST:     ATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACATTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: ATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
EST: gi|208165626|gb|GD963670.1|GD963670
EST:     GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAG                         GGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT
genomic: GCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttc ... ctctatttagGGACTTTTGGCATTGTTGATTACACTAATTATGACGACATGAAGTATGCT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GATCATATGCGAAAAGCTGGTGATGTGTGTTTTGCTGAGGTTTCCCGTGATAGTGAAGgtaaaccttcattttggtttgcggtttgcttaccataaattactatgtttacattgatataagcttatggtgattcatgttttttggtacatctaaaaca

- - - - - -  AAGCTG