1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
TGTGACACAGCATTTATCATTGGGTGGGGAGGTATTTTGGGCTGGTCAGCATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggcttaagacttaccccttcatacattattgatcgcatggcccacccttgatccctccctcttatatttcctattaatctttcatatttgttt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G34360.3 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCG GTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|31311896|gb|CD397099.1|CD397099
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACTACACTGATAAGTCG GTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|120532642|gb|EH260775.1|EH260775
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAATCG GTTGCTACCGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|120533441|gb|EH261574.1|EH261574
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAATCG GTTGCTACCGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|193394687|gb|FK358188.1|FK358188
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCG GTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAAATGGTTCTTCTAAGCEST: gi|209707360|gb|BW670910.1|BW670910
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAA-TGGTTCTTCTAAGC
EST: CACTGATAAGTCG GTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAAT-GTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|207734720|gb|GD710151.1|GD710151
genomic: CACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAATCG GTTGCTACCGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTTEST: gi|192322688|gb|FK015025.1|FK015025
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
EST: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCG GTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
genomic: ATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggc ... ctacatccagGTTGCTACAGGGCAAGTTGCTAGCACTGGAATGGTTCTTCTAAGCTATGTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGTGACACAGCATTTATCATTGGGTGGGGAGGTATTTTGGGCTGGTCAGCATCGGAAGTCTGGTATTGGTTATGCTGCTCGCTACAACACTGATAAGTCGgtatgatggcttaagacttaccccttcatacattattgatcgcatggcccacccttgatccctccctcttatatttcctattaatctttcatatttgttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT