1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
ATGTGTTGTGGTGGAGGACAGTGCCATAGGCTTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttctacttactatattcagctttgtgttttctaaatttctacttgattgataggctatatgaatatgctacttgttggattgacctccattgat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G36600.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|120495078|gb|EH223245.1|EH223245
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|151405279|gb|EV275093.1|EV275093
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: AGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|209704520|gb|BW680650.1|BW680650
genomic: AGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|8670194|gb|BE191301.1|BE191301
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|20811539|gb|BQ296017.1|BQ296017
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|9258673|gb|BE346820.1|BE346820
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|22522399|gb|BU081210.1|BU081210
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|209718041|gb|BW671874.1|BW671874
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|31311871|gb|CD397074.1|CD397074
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACCAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|31310757|gb|CD395960.1|CD395960
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACTAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|8669990|gb|BE191097.1|BE191097
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|192318370|gb|FK011026.1|FK011026
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|6718650|gb|AW306297.1|AW306297
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|31307094|gb|CD392297.1|CD392297
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|9564563|gb|BE474072.1|BE474072
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCATEST: gi|11411417|gb|BF423428.1|BF423428
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
EST: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGG CTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
genomic: TTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttct ... ccaaatgcagCTATACAGCAGATGAAGATTTCTTAAATGCAGATGCAGTCTTTGACTGCAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATGTGTTGTGGTGGAGGACAGTGCCATAGGCTTAGCAGCTGCTAAAGCAGCTGGAATGACGTGTATAGTAACAAAGAGCGGgtatgtttctacttactatattcagctttgtgttttctaaatttctacttgattgataggctatatgaatatgctacttgttggattgacctccattgat
- - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA