Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCAGCTATGCATGGTAAAATTGATCCTGCTGTTCTAGCCTCATTGCCTCCATCAATGCAACTGGACCTTCTTGTTCAGgtaattgagttcataaagtatttttttagaaaaagtaccttttacattttattctgatatcagtgattgaataattattctgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA01G16370.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA01G16370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 7
lower sequence: LOC_Os03g10780.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 4
CCAGCTATGCATGGTAAAATTGATCCTGCTGTTCTAGCCTCATTGCCTCCATCAATGCAACTGGACCTTCTTGTTCAGgtaattgagttcataaagtatttttttagaaaaagtaccttt-tacattttattct--gatatcagtgattgaataattattctgcag---------
||    |     ||| | ||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    |   || || || |  ||   |       ||||  ||| ||  | | |  |  | ||| || | | | |  |   |             
CCTATGACAACAGGTGATATTGATCCTGCAGTATTAGCTTCACTCCCTCCATCAATGCAGTTGGATCTTCTTGTTCAGgtaaagagg---atgaactactggttctcatgtttctccttggtaccttaaactgtatgcaaccagagactaatttaagagaatatgattggtttag