Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATCCCAATATGGAAAGACGTATCACCACGTCTAAGGAAGGTTAATGCAGCTCTCAAATTAATCAATGATACGCTTGATGATCTGATAGCAATATGCAAGgtaatgttgtcattagtgttacacaagcttgcattctcaaaataggttcacataagatggtatgcaatatgtgatgccactgcagaaaggcacttgtaaa...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G47500.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7588874|gb|AW704660.1|AW704660
EST:     TCAATGATACGCTTGATGATCTGATAGCAATATGCAAG                         AGAATGGTGGATGAAGAAGAGTTACAGTTTCATGAGGAGTACATGAATGAG
genomic: TCAATGATACGCTTGATGATCTGATAGCAATATGCAAGgtaatgttgt ... tcattttcagAGAATGGTGGATGAAGAAGAGTTACAGTTTCATGAGGAGTACATGAATGAG
EST: gi|7588838|gb|AW704625.1|AW704625
EST:     TCAATGATACGCTTGATGATCTGATAGCAATATGCAAG                         AGAATGGTGGATGAAGAAGAGTTACAGTTTCATGAGGAGTACATGAATGAG
genomic: TCAATGATACGCTTGATGATCTGATAGCAATATGCAAGgtaatgttgt ... tcattttcagAGAATGGTGGATGAAGAAGAGTTACAGTTTCATGAGGAGTACATGAATGAG