1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
TTTTGGGCAGCCTATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAGgttatattcttgctggccatgtactttttgaggtcattttattgtgctttgtattatggaaagacaacttcacctttttctctccttttggattcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G05530.4 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GGATACCTCAG GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCAEST: gi|208252931|gb|GE056729.1|GE056729
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EST: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAA GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGACCTGAGGTTACAGATGCCAEST: gi|6454619|gb|AW185302.1|AW185302
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EST: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAG GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCAEST: gi|14126550|gb|BG790988.1|BG790988
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EST: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAG GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGACGTTACAGATGCCAEST: gi|208171149|gb|GD967892.1|GD967892
genomic: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAGgttatattct ... ttggattcagGTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCA
EST: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAG GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCGAEST: gi|208277576|gb|GE079567.1|GE079567
genomic: TATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAGgttatattct ... ttggattcagGTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCA
EST: CAGCCAGAGAGAGGATACCTCAG GTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCA
genomic: CAGCCAGAGAGAGGATACCTCAGgttatattct ... ttggattcagGTCACTTTAATATTTTTGTCGGTGACCTTAGTCCTGAGGTTACAGATGCCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTTTGGGCAGCCTATTAAGGTTAACTGGGCTTATGCTAGCAGCCAGAGAGAGGATACCTCAGgttatattcttgctggccatgtactttttgaggtcattttattgtgctttgtattatggaaagacaacttcacctttttctctccttttggattcag
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