Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCCTGTGTACATAGCTGAGATATCACCTCCAAACTTGAGGGGGGGTTTGGTTTCAGTTAACCAGgttggttgataccaccaagatattgatgatttaatgctagatattaacagtttttaacatttcctagattagtgatctttgttgtttcttttctgcatag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G08070.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA14G08070.1 (Glycine max), 5'ss of exon 6
lower sequence: Vv18s0001g12560.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 6
GTGCCTGTGTACATAGCTGAGATATCACCTCCAAACTTGAGGGGGGGTTTGGTTTCAGTTAACCAGgttggttgataccaccaagatattgat----gatttaatgctag----atattaa------cagtttttaacatttcctagattagtg-atctttgttgtttcttttctgcatag
|| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || || |||| |||||| |||||||||  |   |   |      | ||| |    | || |||| | |     |||| |       || ||   |  ||    |    ||   |  ||  || | | |||  ||  |||
GTACCTGTGTACATAGCTGAAATATCACCTCAGAACTTGAGAGGAGGCTTGGGTTCAGTGAACCAGgttactgtgtttaatggcttttttgtttttggcttaaatggtggtgttgtattcaaaagactagcttcagattttattcatgacagcctaatttccttttgtttttgttgtgtag