Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAGATGCCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatcctttctatacctgtacctataatttatttctgtttgatcgcattattttgctcacctcattacttttttttttttttttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G33800.3
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193471964|gb|FK437807.1|FK437807
EST:     GGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|207679439|gb|GD662115.1|GD662115
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193499787|gb|FK464704.1|FK464704
EST:     GAAAAGTAGAATTGGTCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: G-AAAGT-GAA-TGG-CACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193657673|gb|FK607216.1|FK607216
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|207734138|gb|GD711990.1|GD711990
EST:     CCAGTAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCAG-AAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208138756|gb|GD938082.1|GD938082
EST:     -CCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193325579|gb|FK288987.1|FK288987
EST:     AGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: AGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193352296|gb|FK314270.1|FK314270
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193460878|gb|FK428431.1|FK428431
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|192321935|gb|FK012487.1|FK012487
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193695981|gb|FK636119.1|FK636119
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193648791|gb|FK600674.1|FK600674
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTA
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTA
EST: gi|209711178|gb|BW676451.1|BW676451
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|58018472|gb|CX705214.1|CX705214
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208206699|gb|GE004604.1|GE004604
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193420656|gb|FK386995.1|FK386995
EST:     AGCTTGGTGGAGGTTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: AGCTTGGTGGAGG-TGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|163922893|gb|EH039539.1|EH039539
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193699150|gb|FK636343.1|FK636343
EST:     GGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193486616|gb|FK452633.1|FK452633
EST:     TGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: TGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208037924|gb|GD835700.1|GD835700
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208320379|gb|GE122100.1|GE122100
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|207752063|gb|GD722152.1|GD722152
EST:     TGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: TGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|214006758|gb|DB987640.1|DB987640
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208196574|gb|GD993203.1|GD993203
EST:     CCAGTAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCAG-AAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|192332264|gb|FK023913.1|FK023913
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208215481|gb|GE012482.1|GE012482
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         CGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208254941|gb|GE056905.1|GE056905
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208111237|gb|GD910047.1|GD910047
EST:     GGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193497915|gb|FK458711.1|FK458711
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|192322094|gb|FK012198.1|FK012198
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|10848101|gb|BF070654.1|BF070654
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATT
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATT
EST: gi|31456844|gb|CD398872.1|CD398872
EST:     CCAGAAAGTGAATGGCGACAGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGATTTG
genomic: CCAGAAAGTGAATGGC-ACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCG-TTTG
EST: gi|193493809|gb|FK458431.1|FK458431
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCAATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|5666946|gb|AI930982.1|AI930982
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208139224|gb|GD936030.1|GD936030
EST:     GGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|254334704|gb|GR844489.1|GR844489
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|207843408|gb|GD814797.1|GD814797
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208148459|gb|GD951125.1|GD951125
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|254345747|gb|GR859394.1|GR859394
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|209703893|gb|BW670748.1|BW670748
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|15336997|gb|BI497653.1|BI497653
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208313927|gb|GE114285.1|GE114285
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208209500|gb|GE005212.1|GE005212
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|209716797|gb|BW679589.1|BW679589
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|58015906|gb|CX702648.1|CX702648
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208198601|gb|GD998450.1|GD998450
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGC
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGC
EST: gi|208186292|gb|GD984597.1|GD984597
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGG
EST: gi|208318426|gb|GE110277.1|GE110277
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATTGCATGCGTTTG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGAT-GCATGCGTTTG
EST: gi|193332488|gb|FK297742.1|FK297742
EST:     AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|14126273|gb|BG790711.1|BG790711
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193491652|gb|FK456918.1|FK456918
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193714784|gb|FK652765.1|FK652765
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGG
EST: gi|208041194|gb|GD842637.1|GD842637
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|209720671|gb|BW677514.1|BW677514
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|193398296|gb|FK364666.1|FK364666
EST:     AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         T
genomic: AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcag-
EST: gi|193398296|gb|FK364666.1|FK364666
EST:     AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         T
genomic: AGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcag-
EST: gi|193389372|gb|FK353977.1|FK353977
EST:     GTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208162158|gb|GD965269.1|GD965269
EST:     TGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGGTTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: TGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208149362|gb|GD948892.1|GD948892
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTT
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTT
EST: gi|7041625|gb|AW471577.1|AW471577
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|8825984|gb|BE209714.1|BE209714
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208040831|gb|GD843338.1|GD843338
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208164677|gb|GD961111.1|GD961111
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208321114|gb|GE118649.1|GE118649
EST:     GTGAATGGCACTTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: GTGAATGGCAC-TGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: gi|208184112|gb|GD982376.1|GD982376
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATG
EST: gi|208167567|gb|GD965177.1|GD965177
EST:     CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAG                         TGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatc ... ttttttgcagTGAGTCCGATTGTTGATGGGATCTTCCTTAGGATTCGATGCATGCGTTTGG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AAGATGCCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGAGGCAGAGgttagtaatcctttctatacctgtacctataatttatttctgtttgatcgcattattttgctcacctcattacttttttttttttttttgcag

- - - - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - -  GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG