Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCGATACATTGACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgtccattgatgtaaaagtttgatgttctgttattggatgttgattttatgtttggttaaggttttcaatatcttaacctaaatggctttact...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G34180.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254336966|gb|GR843145.1|GR843145
EST:     ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
genomic: ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
EST: gi|193562436|gb|FK518225.1|FK518225
EST:     CCAGTTTGGGGTTATTAAGTACTTTCTTGGTGATGTTCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
genomic: CCAGTTTGGGGTTATTAAG-AC-TTC-TGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
EST: gi|193680450|gb|FK624370.1|FK624370
EST:     CCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
genomic: CCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
EST: gi|151395590|gb|EV265467.1|EV265467
EST:     ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
genomic: ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
EST: gi|21285502|gb|BQ473373.1|BQ473373
EST:     ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTCCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTT
genomic: ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTT
EST: gi|193712601|gb|FK649708.1|FK649708
EST:     ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCA                         GTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG
genomic: ACATTGAAACATGCCAGTTTGGGGTTATTAAGACTTCTGGTGATGTTCCAgtaagtgtgt ... atttttccagGTAGCTCGTGTGGGACAGTCTGCCACAATGGTTGGTTCCAGAGTGATATTG