Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGCGGCAACAAACAACTTGTTTGGCATGCTTGTAGGAAGGTTGTTTGTTGGGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaatcactaaattggtgcatctgtctcattgactagactgaaaatttacttgattattctcttgaatggcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA07G09270.3
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|26058787|gb|CA801701.1|CA801701
EST:     GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAG                         GTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
genomic: GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaat ... tgaatggcagGTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
EST: gi|254339874|gb|GR857999.1|GR857999
EST:     GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAG                         GTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
genomic: GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaat ... tgaatggcagGTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
EST: gi|15200276|gb|BI424265.1|BI424265
EST:     GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAG                         GTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
genomic: GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaat ... tgaatggcagGTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
EST: gi|15200088|gb|BI424166.1|BI424166
EST:     GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAG                         GTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
genomic: GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaat ... tgaatggcagGTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
EST: gi|192294070|gb|FG986159.1|FG986159
EST:     GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAG                         GTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC
genomic: GGACTGGCTTGGGCCTGGGCCCTCCTGTTGCCTCTCTGTATGTGACAGAGgtatgtaaat ... tgaatggcagGTTTCTCCTGCTTTTGTGCGGGGCACCTTTGGAGCTTTCATCCAGATTGCC