1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
AAAAGCAATCAATAAGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttgatatatgcattccttcttgtttgtatcactattaagatacaagtatacgtagtgctcatatttttgttctttgatgtagtacctggaataa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G41130.1 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|208047854|gb|GD845245.1|GD845245
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGEST: gi|151410220|gb|EV280035.1|EV280035
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTG
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|151413172|gb|EV282980.1|EV282980
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|193364720|gb|FK330135.1|FK330135
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|208333078|gb|GE127383.1|GE127383
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTEST: gi|208192873|gb|GD991128.1|GD991128
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCT
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|193691396|gb|FK633643.1|FK633643
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|208134219|gb|GD931354.1|GD931354
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCEST: gi|193414426|gb|FK379218.1|FK379218
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTC
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTAGAATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATEST: gi|208075247|gb|GD877242.1|GD877242
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTT-GA-TTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAAT
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGAEST: gi|151395221|gb|EV265092.1|EV265092
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
EST: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAG ATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
genomic: AGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttga ... tacattgtagATGGAGAAGCTTGATTAAAGATGTCGTGGAAGCTTCAGTGCTTACTAATGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AAAAGCAATCAATAAGGGCATTGGGGTTGACAACTTGCATTATCTCAATGATGGTCTTTGGAAGgtatggttgatatatgcattccttcttgtttgtatcactattaagatacaagtatacgtagtgctcatatttttgttctttgatgtagtacctggaataa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG