1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
AGCTGGCACATCCAAATGCTCCCCTTGGATATGGGTTGTGTTTCCTGAACCTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatagagaaattcctgtctgtctgatgtcatgcaaactaccaaatttgcaaatgcaattccttgatttcctctttactttttcacccccccttat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G05170.1 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|19268926|gb|BM885182.1|BM885182
genomic: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|13563069|gb|BG551289.1|BG551289
genomic: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|254325032|gb|GR834457.1|GR834457
genomic: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAG-ATTCTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|22927568|gb|BU544707.1|BU544707
genomic: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: CTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATNNNGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|19453112|gb|BM954522.1|BM954522
genomic: CTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGGEST: gi|9898745|gb|BE607713.1|BE607713
genomic: CTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
EST: TTAAAAGCAAG GTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
genomic: TTAAAAGCAAGgtaataatag ... gccttaccagGTATCCAAAAACAAGTGCTTGGGATATTATGCTGGGCATGAATTTATGGGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGCTGGCACATCCAAATGCTCCCCTTGGATATGGGTTGTGTTTCCTGAACCTTGCTTTTGATGGATTTACCAATGCAACTCAGGATTCTTTAAAAGCAAGgtaataatagagaaattcctgtctgtctgatgtcatgcaaactaccaaatttgcaaatgcaattccttgatttcctctttactttttcacccccccttat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccccccc