1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
TCTTCAGTGCTTCATTCACAACCAAAGTCAACTGTGGGAACTCCTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtttactgtttagtttcatggtattgttctttttctgtagattaattaattattactgtcacaattaaatgaacaattttgtagttaacttgt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G20610.3 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|18714643|gb|BM522792.1|BM522792
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|15662107|gb|BI699478.1|BI699478
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|254320505|gb|GR826954.1|GR826954
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|20811762|gb|BQ296240.1|BQ296240
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|254342837|gb|GR858999.1|GR858999
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATA-TGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGAEST: gi|120533008|gb|EH261141.1|EH261141
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
EST: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAG CTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
genomic: CTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtt ... ttaatattagCTTGCAGATGTCTGGTCATGTGGAGTAACCTTATATGTGATGCTAGTGGGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCTTCAGTGCTTCATTCACAACCAAAGTCAACTGTGGGAACTCCTGCATATATTGCTCCAGAAGTATTGCTGAAACAAGAGTATGATGGCAAGgtagagtgtttactgtttagtttcatggtattgttctttttctgtagattaattaattattactgtcacaattaaatgaacaattttgtagttaacttgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT