1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
CTAGATAGTAGTTCTGATCATCAAGAGAAACTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgtctgtcagtgtattttattttccatttcatttacccatgttcactgtgtgttcactttgttttattatgaatgtccag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G00560.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|192298363|gb|FG992123.1|FG992123
genomic: GTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: GCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|13791187|gb|BG653778.1|BG653778
genomic: GCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|151411149|gb|EV280960.1|EV280960
genomic: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|9258723|gb|BE346870.1|BE346870
genomic: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: CCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|192306193|gb|FG995043.1|FG995043
genomic: CCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: GGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTAEST: gi|192306183|gb|FG995033.1|FG995033
genomic: GGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
EST: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTG GTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
genomic: CTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgt ... gaatgtccagGTATGATGCGACAATTGAGGCTTATACTCCAAATGGTTATTATGTAAGCTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTAGATAGTAGTTCTGATCATCAAGAGAAACTTCCTGTTGGCACCAAAGTTCAGGCAGTTTGGAGTGAAGATGGGGAGTGgtattgttgtctgtcagtgtattttattttccatttcatttacccatgttcactgtgtgttcactttgttttattatgaatgtccag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG