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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACAAAAGTGAATAATCCTTGCAGTAGCGGTGAAAGCACTCCTAAAGTGTGGCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggttttagtggttttccttagtagtttcaaattgattttctttgttgattacatgcatgcatggcatttttatggagtgttgttataaatataggt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G29740.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|19053052|gb|BM731719.1|BM731719
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|58016997|gb|CX703739.1|CX703739
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|21479821|gb|BQ576504.1|BQ576504
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATGGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|26049069|gb|CA785522.1|CA785522
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|58016753|gb|CX703495.1|CX703495
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|120528797|gb|EH256931.1|EH256931
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|120531655|gb|EH259788.1|EH259788
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
EST: gi|193546523|gb|FK501832.1|FK501832
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATGGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTG
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTG
EST: gi|6666602|gb|AW278061.1|AW278061
EST:     GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAG                         TTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC
genomic: GCCAGTTGGTGAATCTAATTGTCAAGGGAATAAAATCCATCCATTGAGAGgcaaggtttt ... cttaatgcagTTCTTCCAGATTTTACTCAGGTATATGGCTTCATTGGCAGTGTATTTGACC