Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACTTGCAACTTTGGAGCAGGGAAACATTGATCCATATAGCATTTATACACCAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagcttttatatcaacatattcaattttttacttaataacatgacacctagatataagtcattgcatgccattgtagttgtgaatcagaacaatgtaa...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G26070.2
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|13789996|gb|BG652587.1|BG652587
EST:     CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
EST: gi|58019406|gb|CX706148.1|CX706148
EST:     CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
EST: gi|10846445|gb|BF071337.1|BF071337
EST:     CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
EST: gi|193435150|gb|FK399832.1|FK399832
EST:     GGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: GGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
EST: gi|51336355|gb|CO980221.1|CO980221
EST:     CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
EST: gi|58016301|gb|CX703043.1|CX703043
EST:     CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTAT                         CCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG
genomic: CAGTATGCAATGATATAGCAGCAATCAAACGCCGTTTGGGGGGTCGCTATgtaagctttt ... ccaaacccagCCATGGTTGTCTCGAGCATATGATCCCTGTACTGAGAGGTACTCTACCTTG