1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
CTCAAGAGGGAATTACTGCTTCTATCTGTGGGTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaactttacatttgcatgctctgtctcaaaaaataaaaataaaaagtcttatccatttgctattataattcagaaccagatcatttttgtgcttctta...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA12G09720.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAG GTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAGEST: gi|31476111|gb|CD418139.1|CD418139
genomic: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaacttta ... aaatgtgtagGTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAG
EST: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAG GTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAGEST: gi|192296222|gb|FG989763.1|FG989763
genomic: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaacttta ... aaatgtgtagGTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAG
EST: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAG GTTGCTATAAGTTATGCGATTGGGAGTCCTTTTCAGEST: gi|193321640|gb|FK285300.1|FK285300
genomic: GTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaacttta ... aaatgtgtagGTTGCTATAAGTTATGCGATTGG-AGTCCTTTTCAG
EST: TTGGTTATTTTGTCCGTACAG GTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAG
genomic: TTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaacttta ... aaatgtgtagGTTGCTATAAGTTATGCGATTGGAGTCCTTTTCAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCAAGAGGGAATTACTGCTTCTATCTGTGGGTATTGGATTGGCTTGTAGTGGATATTGCTTGGTTATTTTGTCCGTACAGgtaaactttacatttgcatgctctgtctcaaaaaataaaaataaaaagtcttatccatttgctattataattcagaaccagatcatttttgtgcttctta
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