1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
ATACTTTAAGGGGCCTGAACTTCTAGTTGATTTGCAAGACTATGACTACTCATTAGACATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATGgtgtgaattataactataagttactggttatatatggcatactcttgacatttatgcagatggtctaaatttgagcgtacatgattaaaaatgtaaaattctggtcataatttgttcgttgtactcttttgtag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G05340.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATGACTACTCATTAGACATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATG ATATTTCGCAAAGAACCTTTCTTTTATGGTCATGACAACCATGATCAGCTTEST: gi|208215776|gb|GE008544.1|GE008544
genomic: ATGACTACTCATTAGACATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATGgtgtgaatta ... tcttttgtagATATTTCGCAAAGAACCTTTCTTTTATGGTCATGACAACCATGATCAGCTT
EST: GAGCCTTGGCTGTCTATGTTTGCTGGAATG ATATTTCGCAAAGAACCTTTCTTTTATGGTCATGACAACCATGATCAGCTTEST: gi|20813341|gb|BQ297819.1|BQ297819
genomic: GAGCCTTGGCTG-C-ATGTTTGCTGGAATGgtgtgaatta ... tcttttgtagATATTTCGCAAAGAACCTTTCTTTTATGGTCATGACAACCATGATCAGCTT
EST: ATGACTACTCATTAGATATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATG ATATTTCGCAAAGAACC
genomic: ATGACTACTCATTAGACATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATGgtgtgaatta ... tcttttgtagATATTTCGCAAAGAACC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATACTTTAAGGGGCCTGAACTTCTAGTTGATTTGCAAGACTATGACTACTCATTAGACATGTGGAGCCTTGGCTGCATGTTTGCTGGAATGgtgtgaattataactataagttactggttatatatggcatactcttgacatttatgcagatggtctaaatttgagcgtacatgattaaaaatgtaaaattctggtcataatttgttcgttgtactcttttgtag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA