Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCTTGTATGGAACAATGGTGGTGGGTTTGACCATAACCCTTTTGACTCTTTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAGgtgggtttctagttgaatatacaccactgaaatactttgtctttatttatgtcttggaagatttcattttgtcttttttttttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35270.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|22930152|gb|BU547291.1|BU547291
EST:     TTTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAG                         TATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGNNNGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC
genomic: TTTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAGgtgggtttct ... tttttttcagTATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGTTGGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC
EST: gi|193649644|gb|FK596781.1|FK596781
EST:     TTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAG                         TATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGTTGGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC
genomic: TTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAGgtgggtttct ... tttttttcagTATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGTTGGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC
EST: gi|193643011|gb|FK588165.1|FK588165
EST:     TTTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAG                         TATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGTTGGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC
genomic: TTTTTGGATGGCATGTCTACCTTATCCTTCATAACATGACAACCATAGAGgtgggtttct ... tttttttcagTATTATGAAGGAAAGCGTGCAAAATGGTTGGCTATGAAGTCTGGGCAAAGC