1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
TCATATTCATTTTCAGTTCCACAGCAGTGTTCCTCATCTTCTAATCTGAAGTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacattcttacatttccaagggatttatgaaaatgcattctcaaacaagaaatgcattgctgatctaagaaaatttcataattacattcattaat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G32390.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GAGAAGATTTGTATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208094526|gb|GD894965.1|GD894965
genomic: GAGAAGA-TTG-ATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: AGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193459071|gb|FK422914.1|FK422914
genomic: AGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|209716004|gb|BW668591.1|BW668591
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193474353|gb|FK442030.1|FK442030
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193461881|gb|FK428550.1|FK428550
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|254328079|gb|GR835044.1|GR835044
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193564775|gb|FK521934.1|FK521934
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGAACAAAAACCAGTAGCAGCTEST: gi|193309716|gb|FK274508.1|FK274508
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTG-AC-AAAACCAGTAGCAGCT
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACGAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208211312|gb|GE013983.1|GE013983
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208047728|gb|GD843929.1|GD843929
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207777992|gb|GD747939.1|GD747939
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208260487|gb|GE058067.1|GE058067
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208298083|gb|GE093256.1|GE093256
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193616599|gb|FK567797.1|FK567797
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208214230|gb|GE014591.1|GE014591
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|17023753|gb|BM094787.1|BM094787
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAEST: gi|207703952|gb|GD685942.1|GD685942
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAA
EST: GAGAAGATTTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACGAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193313070|gb|FK282399.1|FK282399
genomic: GAGAAGA-TTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|13481390|gb|BG510733.1|BG510733
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193624061|gb|FK573899.1|FK573899
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGTAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGEST: gi|208243169|gb|GE040277.1|GE040277
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAG-AGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAG
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193372239|gb|FK335456.1|FK335456
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207779651|gb|GD752511.1|GD752511
genomic: GCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193338975|gb|FK302698.1|FK302698
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193308047|gb|FK273483.1|FK273483
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193725347|gb|FK657247.1|FK657247
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193426994|gb|FK397497.1|FK397497
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACTAGTAGCAGCTGCEST: gi|193435166|gb|FK400282.1|FK400282
genomic: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: TGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|17021298|gb|BM092332.1|BM092332
genomic: TGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAEST: gi|193380455|gb|FK346943.1|FK346943
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGA
EST: GGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208228363|gb|GE021109.1|GE021109
genomic: GGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCNGTAGCAGCTGCEST: gi|207731102|gb|GD705567.1|GD705567
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193656812|gb|FK607148.1|FK607148
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193384841|gb|FK353199.1|FK353199
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTCGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193464729|gb|FK432293.1|FK432293
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: TTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGCTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|209699469|gb|BW667655.1|BW667655
genomic: TTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207685680|gb|GD669614.1|GD669614
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208226341|gb|GE021440.1|GE021440
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGA-TGANATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208299311|gb|GE098782.1|GE098782
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193371857|gb|FK336026.1|FK336026
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|214007412|gb|DB986264.1|DB986264
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208182592|gb|GD980815.1|GD980815
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|151407179|gb|EV276994.1|EV276994
genomic: GAGAAGA-TTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193614299|gb|FK561837.1|FK561837
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193304706|gb|FK272191.1|FK272191
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193331395|gb|FK293303.1|FK293303
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208114715|gb|GD911262.1|GD911262
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193335238|gb|FK297978.1|FK297978
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGACAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGEST: gi|193665028|gb|FK611702.1|FK611702
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAG-CAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTG
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193375740|gb|FK340495.1|FK340495
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193376306|gb|FK339619.1|FK339619
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208312175|gb|GE109915.1|GE109915
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193638119|gb|FK586613.1|FK586613
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGACG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193339158|gb|FK304435.1|FK304435
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193363176|gb|FK326182.1|FK326182
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|22932945|gb|BU550084.1|BU550084
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193644185|gb|FK590308.1|FK590308
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|15202915|gb|BI425683.1|BI425683
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208311815|gb|GE109037.1|GE109037
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193439542|gb|FK406795.1|FK406795
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: CCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207746409|gb|GD720165.1|GD720165
genomic: CCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193492215|gb|FK455255.1|FK455255
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193428099|gb|FK398801.1|FK398801
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|9258350|gb|BE346497.1|BE346497
genomic: GAGAAGA-TTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|8401534|gb|BE057098.1|BE057098
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208038981|gb|GD832823.1|GD832823
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTTGTATTATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207795679|gb|GD766900.1|GD766900
genomic: GAGAAGA-TTG-A-TATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193711320|gb|FK643901.1|FK643901
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: ATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193676962|gb|FK619176.1|FK619176
genomic: ATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208057594|gb|GD851703.1|GD851703
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGACG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|6848840|gb|AW351130.1|AW351130
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208124475|gb|GD925069.1|GD925069
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGEST: gi|208305914|gb|GE109593.1|GE109593
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTG
EST: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|207700619|gb|GD683726.1|GD683726
genomic: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|193454006|gb|FK419593.1|FK419593
genomic: GAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|20814272|gb|BQ298750.1|BQ298750
genomic: GAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGCEST: gi|208332763|gb|GE129084.1|GE129084
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
EST: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATG GAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCNGTAGCAGCTGC
genomic: GTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacat ... ttcaatgcagGAGCTATGTGAGGTTGATGTTGTTCTTGTTGACAAAACCAGTAGCAGCTGC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCATATTCATTTTCAGTTCCACAGCAGTGTTCCTCATCTTCTAATCTGAAGTGGCCATGGCAAGAGAAGATTGATATGGAGCAGAGTTCAAGCAAAGATGgtaagtacattcttacatttccaagggatttatgaaaatgcattctcaaacaagaaatgcattgctgatctaagaaaatttcataattacattcattaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -acaagaaa