Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAAGCACCTTCATCAGGGTCCACCACCTGCCTATGTAAGAGATGTTTCTATGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatccttttttccccaaatgagtattgcagacagcagcattgcttttgaagcatttttttttattttttgtgacttaatatgatttcttttgtactatgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G03910.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|8282513|gb|BE020004.1|BE020004
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|254323299|gb|GR840104.1|GR840104
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATTTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|17963169|gb|BM269921.1|BM269921
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|31460923|gb|CD402951.1|CD402951
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|9902211|gb|BE611179.1|BE611179
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|51337757|gb|CO981623.1|CO981623
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|18734549|gb|BM528247.1|BM528247
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|254323298|gb|GR840103.1|GR840103
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAA                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
EST: gi|17401691|gb|BM178473.1|BM178473
EST:     TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAG                         GTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA
genomic: TGGGAATTCATTCATCCAGTGCACAGGCACAACAATCTGTTGTGACTAAGgtatcctttt ... tactatgtagGTCACACAACACATGCAAATTCCTTTGTCCTATGCAGATGCTGTTATTGGA