Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAAGCAGCAGCAGCAGGTAGATAGAGGAGATTTTTCACCATGTGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatggtggaaacttccattttattatcttttcagattgtgtctttgtcaaacctactctactcaacacgtgtactttcttaattgcatgcttttag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G35980.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208333393|gb|GE126158.1|GE126158
EST:     TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
EST: gi|7693469|gb|AW761561.1|AW761561
EST:     TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
EST: gi|13788001|gb|BG650593.1|BG650593
EST:     TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
EST: gi|13787910|gb|BG650502.1|BG650502
EST:     TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
EST: gi|17152898|gb|BM142831.1|BM142831
EST:     TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: TGGTACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
EST: gi|308098408|gb|HO760149.1|HO760149
EST:     ACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTG                         GTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG
genomic: ACTCCTACTGGATTGGATGCTAGAGACCAATTTGATCTTCAACTTGgtaggttatg ... atgcttttagGTGGCAGAATGCTCTACAATACTCAAGACATGCTGTGGAGGAGGAAGCTGG