1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
GAAGGATCAAGCAAGAGATATGTGGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactggattccttatattatttagtattgttgttcagagttgaatgtgaatgagtagaaagcttattcattttttttctcattgttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G18500.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTGCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATGEST: gi|7478474|gb|AW666280.1|AW666280
genomic: ATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATG
EST: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATGEST: gi|120533717|gb|EH261850.1|EH261850
genomic: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATG
EST: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATGEST: gi|209706232|gb|BW656737.1|BW656737
genomic: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATG
EST: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATGEST: gi|8670000|gb|BE191107.1|BE191107
genomic: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATG
EST: ATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATGEST: gi|208300335|gb|GE097650.1|GE097650
genomic: ATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATTGGAAGAATTGAATGGTTGCATG
EST: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTG GTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATT
genomic: GGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactg ... tcattgttagGTGTGGAAAGCAAGTTCGGTGTGGGTATT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAAGGATCAAGCAAGAGATATGTGGGTGTTCCGGGCATGAATTCTATATGCAAAGCATTATGCAATGAGAGTGgtatctactggattccttatattatttagtattgttgttcagagttgaatgtgaatgagtagaaagcttattcattttttttctcattgttag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAAG