1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
ACTGACACGGCTTCTGTCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatgtttattctcctctgtcaatttttgcaaacaaccacgagagtcagtgaatagtactcatggcacgctagatgttaaaagtccattatttcacgttgttctaatccttctgcttccactttattagtttttgaagttctaaaaatattctcttttccccgtggatgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G35610.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAG GCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAAEST: gi|13311263|gb|BG404896.1|BG404896
genomic: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatg ... gtggatgcagGCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAA
EST: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAA GCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAAEST: gi|254327515|gb|GR837124.1|GR837124
genomic: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatg ... gtggatgcagGCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAA
EST: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAG GCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAG-AAACATGAGACAGCAAEST: gi|254327516|gb|GR837125.1|GR837125
genomic: TCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatg ... gtggatgcagGCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAA
EST: TATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAG G-CCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAA
genomic: TATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatg ... gtggatgcagGCCCTTAGCTTACCATACTTGGGCAGTGGATCAGGAAACATGAGACAGCAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACTGACACGGCTTCTGTCTTATTAGAAGCTATTGGCTATATCAGATTCCTTCAGAGTCAAATTGAGgtaattaatgtttattctcctctgtcaatttttgcaaacaaccacgagagtcagtgaatagtactcatggcacgctagatgttaaaagtccattatttcacgttgttctaatccttctgcttccactttattagtttttgaagttctaaaaatattctcttttccccgtggatgcag
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