Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTAAAGACGACAGGGGTACCTGGCTTCAACAGCTCACATATGGTGTTTTTGGCTTAGGTAACCAGCAGTATGATCATTTTAATAAGgtaaaattcagatgattttaattttgtttatttgacaaaaacagttcatcatctgatcatcttttcttctgaaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G37850.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA02G37850.1 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: Vv18s0001g07630.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
GTTAAAGACGACAGGGGTACCTGGCTTCAACAGCTCACATATGGTGTTTTTGGCTTAGGTAACCAGCAGTATGATCATTTTAATAAGgtaaaattcagatgat-tttaattttgtttatttgacaaaaacagttcatcatctgatcatcttttcttctgaaacag
     | | || ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||  || ||||| |||||||| ||||||  |||     ||| ||||| ||| |  |||    | | |      |  |||||||      |  || ||||||||
---GGAAAAGAGAGGGAGGCCTGGCTTCAACAACTCACATATGGTGTTTTTGGTCTGGGTAACCGCCAATATGAACATTTTAACAAGgtacgattggtgagatatttaagtttatccatt----atatatctcatagtatctgatggaacct--ttttgaaacag