Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATGTTAGGCATGTGCCTTTTGTGGAAAACGTGGTGGCAATATATAGAAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctctttgttttcagagagctttttcaattgatcaaagaaaaaagctatgtattgcttgatgctggtttgatattgttttttaaaatttgttgatgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G35010.3
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|5058291|gb|AI736767.1|AI736767
EST:     AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
genomic: AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
EST: gi|213617091|gb|DB961571.1|DB961571
EST:     AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTT--CCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
genomic: AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
EST: gi|209704697|gb|BW656675.1|BW656675
EST:     AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAG
genomic: AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAG
EST: gi|192295523|gb|FG988097.1|FG988097
EST:     AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
genomic: AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
EST: gi|254319887|gb|GR830911.1|GR830911
EST:     AGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCGGGGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
genomic: AGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAG-TTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGCCGTGCCAAGCAATTCTTAATTCAACTTCTA
EST: gi|7685076|gb|AW755724.1|AW755724
EST:     AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTG                         GTGATGGGAGGGTTTTGGAGC
genomic: AAGCTTGGATGCCACTTTTTGTGCTAGTTTGTTTCAGCCATGTTCTTCTGgtaaagcctc ... gttgatgtagGTGATGGGAGGGTTTTGGAGC