1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
AATGAGTATGACTACAGCCCTGATGAACCCATCATCAGCAATGCCTCTTGCACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgccttgtcaccacatttttttaagttcattccccatccatcaaattgaagcgtgcttcaaatgaaacaaaacaagtaactagaactttataaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G28240.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACGCTTTGTCAATGTCCTTGATCAGAAATGCG GTATCATGCAAGG-TACCATGACCAGCACTCACTTCTACAEST: gi|22932679|gb|BU549818.1|BU549818
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCAT-CAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACA
EST: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16279244|gb|BI943334.1|BI943334
genomic: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTGTGTCAATGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAATGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|27423704|gb|CA935224.1|CA935224
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16343026|gb|BI968621.1|BI968621
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTNACTGCCTNGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTNNNACACCGGTGACCAAAEST: gi|16279009|gb|BI943209.1|BI943209
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209716985|gb|BW654388.1|BW654388
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: GATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16278791|gb|BI943097.1|BI943097
genomic: GATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAAGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16278224|gb|BI942792.1|BI942792
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|23732536|gb|BU764429.1|BU764429
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16284924|gb|BI946341.1|BI946341
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|17519373|gb|BM188415.1|BM188415
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACEST: gi|209728330|gb|BW658542.1|BW658542
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGAC
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGAEST: gi|17519017|gb|BM188059.1|BM188059
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209699080|gb|BW652873.1|BW652873
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGAEST: gi|120534374|gb|EH262507.1|EH262507
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|17518543|gb|BM187585.1|BM187585
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACTTTTGTACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAEST: gi|15589817|gb|BI674433.1|BI674433
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTAC-CATG-ACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16281806|gb|BI944679.1|BI944679
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16281753|gb|BI944650.1|BI944650
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAAGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16277799|gb|BI942568.1|BI942568
genomic: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120534293|gb|EH262426.1|EH262426
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120534097|gb|EH262230.1|EH262230
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16276606|gb|BI941947.1|BI941947
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTTG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCANAEST: gi|16277060|gb|BI942183.1|BI942183
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|17400296|gb|BM177078.1|BM177078
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16277835|gb|BI942587.1|BI942587
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120534345|gb|EH262478.1|EH262478
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16342799|gb|BI968394.1|BI968394
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCANNNNACTCCTACACCGGTGACCAAEST: gi|7924637|gb|AW830663.1|AW830663
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCA-CTCACTCCTACACCGGTGACCAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAAGTCCTTGATCAGAAATTCN GTATCATTAAGGGTACCATGACCACCACTCACTTCTACEST: gi|16344991|gb|BI970586.1|BI970586
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTAC
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTNNNACACCGGTGACCAAAEST: gi|20812662|gb|BQ297140.1|BQ297140
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCCGGTGACCAAEST: gi|16277801|gb|BI942569.1|BI942569
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACC-GGTGACCAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16278320|gb|BI942841.1|BI942841
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCTGTGACCANAEST: gi|16283421|gb|BI945542.1|BI945542
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16284205|gb|BI945961.1|BI945961
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTNTGTCAAGGTGCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120495645|gb|EH223812.1|EH223812
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|23064120|gb|BU578893.1|BU578893
genomic: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGATTTAAEST: gi|16278965|gb|BI943186.1|BI943186
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGA-CCAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|15589943|gb|BI674559.1|BI674559
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|14205704|gb|BG839382.1|BG839382
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120495790|gb|EH223957.1|EH223957
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|5508885|gb|AI855443.1|AI855443
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAATGTACTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAATGGTACCATGACCACCACTCACTACTACACCGTTGACCAAAEST: gi|16277056|gb|BI942181.1|BI942181
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTATGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAATGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209717709|gb|BW654022.1|BW654022
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGEST: gi|23735324|gb|BU765937.1|BU765937
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGG
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|17518877|gb|BM187919.1|BM187919
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: AACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209713044|gb|BW653751.1|BW653751
genomic: AACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGAEST: gi|19346245|gb|BM891125.1|BM891125
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16281836|gb|BI944694.1|BI944694
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209701889|gb|BW652287.1|BW652287
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCCAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACEST: gi|16279186|gb|BI943303.1|BI943303
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTAC
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCN GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGNGACCAAAEST: gi|9259639|gb|BE347786.1|BE347786
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACACTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGEST: gi|16283472|gb|BI945568.1|BI945568
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAG
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209715726|gb|BW657414.1|BW657414
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|23059838|gb|BU578395.1|BU578395
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: TTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16279290|gb|BI943358.1|BI943358
genomic: TTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCT GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120534288|gb|EH262421.1|EH262421
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|19346096|gb|BM890976.1|BM890976
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|209702415|gb|BW656391.1|BW656391
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCA-GGTCCTTGATCAGAAAT-CG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAEST: gi|16276838|gb|BI942071.1|BI942071
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAAGTCCTTGATCAGAAATTCN GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCANAEST: gi|16277482|gb|BI942405.1|BI942405
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCA-A
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|15589869|gb|BI674485.1|BI674485
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16278197|gb|BI942778.1|BI942778
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16279739|gb|BI943591.1|BI943591
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16280002|gb|BI943728.1|BI943728
genomic: CCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|26047975|gb|CA784606.1|CA784606
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120530470|gb|EH258603.1|EH258603
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|17400644|gb|BM177426.1|BM177426
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|23732610|gb|BU764473.1|BU764473
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120531983|gb|EH260116.1|EH260116
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|151397828|gb|EV267701.1|EV267701
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAA-TTCG GTATCATCAAGG-TACCATGAC-ACCACTCACTCCTEST: gi|209717710|gb|BW654023.1|BW654023
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCT
EST: ACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCC-TGATCANGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAEST: gi|31560953|gb|CD486791.1|CD486791
genomic: ACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCA-GAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|120534016|gb|EH262149.1|EH262149
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|31474614|gb|CD416642.1|CD416642
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: TTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16281674|gb|BI944610.1|BI944610
genomic: TTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|23052871|gb|BU577362.1|BU577362
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|16283433|gb|BI945548.1|BI945548
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAAEST: gi|15814783|gb|BI787058.1|BI787058
genomic: GTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
EST: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCG GTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
genomic: CACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgcc ... tccatgacagGTATCATCAAGGGTACCATGACCACCACTCACTCCTACACCGGTGACCAAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AATGAGTATGACTACAGCCCTGATGAACCCATCATCAGCAATGCCTCTTGCACCACTAACTGCCTTGCACCCTTTGTCAAGGTCCTTGATCAGAAATTCGgtaatgtgccttgtcaccacatttttttaagttcattccccatccatcaaattgaagcgtgcttcaaatgaaacaaaacaagtaactagaactttataaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccccatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaacaaaa