Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCATTCAATGGGAGGTTTTGTTGCTAGGGCTGCTGTTATCCACCCTCATCTTAGGAAATCAGCAGTTGAAACTGTTCTTACACTTTCATCCCCACATCAgtatgtttatttcctattattgttattcttgttgtatttctatgtgctgcttaaatgtttgatgggatacatgtattttattcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G24220.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA19G24220.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: Vv13s0047g01150.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 4
GTCATTCAATGGGAGGTTTTGTTGCTAGGGCTGCTGTTATCCACCCTCATCTTAGGAAATCAGCAGTTGAAACTGTTCTTACACTTTCATCCCCACATCAgt---atgtttatttcct--attattgttattcttgtt----gtatttctatgtgctgcttaaatgtttgatgggatacatgtattttattcag
|||| || ||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||   || | |   | ||  |||    | | | | |||    | | |  ||||   || |||  | ||| ||| |||     | |||| | |||
GTCACTCTATGGGTGGTTTTGTTGCTAGAGCTGCAATTGTCCACCCACATTTAAGAAAGTCAGCAGTTGAAACAGTTCTTACACTTTCAAGCCCACACCAgtgagatatatggcttcttgattgacttcactgtggtttccagaaatattatggattggtta--ttttttatgagatttccctgttttttccag