Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTAGTTGATGACTTGGCGAAGGACTTTCCTGATTCAAGTTATAAATTTGGAGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaatatgttactttcttcacaaacaggatgcatgcaccattagcaattatctaaatgaacataactcattgtgtatgtgaaacacttaaaaaga...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G10900.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|308098492|gb|HO760233.1|HO760233
EST:     AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATG                         GATTCCAAAACGCAGACTCGCCCCGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
genomic: AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaat ... tgctttgcagGATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
EST: gi|12690304|gb|BG156640.1|BG156640
EST:     AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATG                         GATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
genomic: AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaat ... tgctttgcagGATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
EST: gi|15200804|gb|BI424548.1|BI424548
EST:     AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATG                         GATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
genomic: AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaat ... tgctttgcagGATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
EST: gi|308097941|gb|HO761112.1|HO761112
EST:     AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATG                         GATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
genomic: AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaat ... tgctttgcagGATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
EST: gi|308098737|gb|HO760478.1|HO760478
EST:     AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATG                         GATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG
genomic: AGATGCATATGATGTTGTTTATGATGTGATTAGCAGTCCAAATAAGTATGgtaagtaaat ... tgctttgcagGATTCCAAAACGCAGACTCGCCCTGTTGTTCCTTTTGGAATATTCGACCCG