Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G33030.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os11g13890.2 (Oryza sativa), 5'ss of exon 4
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct--------
 || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||  |    ||    |   |   ||      ||| | | | |     || | |        | ||   |       || | ||  || || ||   || |        
CCATGCCAGGTGGGCGATGCTCGGCGCCGCTGGGTTCATCATCCCCGAGGCCTGCAACAAGTTTGGCGCAAACTGCGGCCCCGAGGCCGTCTGGTTCAAGgtgcgtgtactagccactgatcatcggcaattca-gctaattcgctgatcactcaagctcaatacctgaatctctgaactgaagtgaactcactcatggtatatgcag

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: AT4G10340.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 4
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtt--tgc--aagctttataacaactttcactgtg--tcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct-
 || || |||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||  |||  | |  | ||    | || || |  |  | |  |||  ||  | |  |    | | |     | |  | |||    |   | ||  |    | |||  
CCATGCGAGATGGGCTATGTTAGGAGCAGCTGGTTTCATCATTCCTGAAGCTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcctacgtctaatctttatttacattcagacttagattctttagcaaagcaagaatgtgttgatgtgatgagatggttctttttggaa-tactgattgcag

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: Vv18s0089g01170.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtc-----aagttcactaatacattatttt--tttatgacact-caacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct
 |||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||   ||| |   |   ||||    |  |     || || |   |  | ||  ||   ||| |    |  ||| ||  | ||||| |   |             
CCACGCCCGGTGGGCTATGCTCGGCGCAGCTGGCTTCATCATCCCTGAGGCCTTCAACAAATTCGGTGCCAACTGCGGCCCTGAAGCTGTGTGGTTCAAGgtttgcttccttaacttcccttttccaaattcctcaaaaaatttatccaccctttccttggatttgtactcccacaagaaggggaattcgaggaaggcag--------

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: EFJ11555 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 4
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct
||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || || ||||| || ||||||||||||||      || || |||     ||| | || ||  |  | | |  || |  ||||||  |    |                                
TCACGCTCGATGGGCGATGCTCGGCGCTGCTGGATTTGTTATTCCCGAGGCTTTCAACAAGTTTGGAGCACAGTGTGGCCCCGAGGCAGTGTGGTTCAAGgtttg------ttctagcaa-----actttctcgagagcttttagatctt-tgcttttat--cctctag-------------------------------

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: EFJ18942 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 4
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct
 |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || || ||||| || ||||||||||||||      || || |||     ||| | || ||  |  | | |  || |  ||||||  |    |                                
CCACGCTCGATGGGCGATGCTCGGCGCTGCTGGATTTGTTATTCCCGAGGCTTTCAACAAGTTTGGAGCACAGTGTGGCCCCGAGGCAGTGTGGTTCAAGgtttg------ttctagcaa-----actttctcgagagcttttagatctt-tgcttttat--cctctag-------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|31311401|gb|CD396604.1|CD396604
EST:     GAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: GAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|20497947|gb|BQ272877.1|BQ272877
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31458462|gb|CD400490.1|CD400490
EST:     GTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: GTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|23063929|gb|BU578703.1|BU578703
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAA-CCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|7145720|gb|AW507642.1|AW507642
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCTGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6727027|gb|AW311381.1|AW311381
EST:     AACAAATATGTAGCTTACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: AACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|8670480|gb|BE191587.1|BE191587
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209725349|gb|BW658247.1|BW658247
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209710534|gb|BW662070.1|BW662070
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|15285587|gb|BI469478.1|BI469478
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACC
EST: gi|11414010|gb|BF425950.1|BF425950
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31459175|gb|CD401203.1|CD401203
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31470063|gb|CD412091.1|CD412091
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|9899088|gb|BE608056.1|BE608056
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209716660|gb|BW682221.1|BW682221
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6134573|gb|AW132966.1|AW132966
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209716659|gb|BW682220.1|BW682220
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGT
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGT
EST: gi|214009654|gb|DB986865.1|DB986865
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|120530661|gb|EH258794.1|EH258794
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31469093|gb|CD411121.1|CD411121
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGTAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|26057166|gb|CA800080.1|CA800080
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|13481927|gb|BG511270.1|BG511270
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|192309277|gb|FG999476.1|FG999476
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209711062|gb|BW665278.1|BW665278
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209710533|gb|BW662069.1|BW662069
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213593074|gb|DB969872.1|DB969872
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31561938|gb|CD487776.1|CD487776
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209702229|gb|BW652362.1|BW652362
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|20448780|gb|BQ252904.1|BQ252904
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAA
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAA
EST: gi|22523574|gb|BU082385.1|BU082385
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|27424688|gb|CA936208.1|CA936208
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC-
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|8669102|gb|BE190204.1|BE190204
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGATGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTANCCTTGAA
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTA-CCTTGAA
EST: gi|209698465|gb|BW667262.1|BW667262
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31462112|gb|CD404140.1|CD404140
EST:     CTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31307545|gb|CD392748.1|CD392748
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|5753301|gb|AI960588.1|AI960588
EST:     CTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGNAGGCTGTT-GGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
genomic: CTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTG-AGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
EST: gi|4313803|gb|AI460922.1|AI460922
EST:     CCTTCAACACATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGNGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|13481887|gb|BG511230.1|BG511230
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209720872|gb|BW662598.1|BW662598
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|9203469|gb|BE329693.1|BE329693
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|151412521|gb|EV282333.1|EV282333
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31461523|gb|CD403551.1|CD403551
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|7232430|gb|AW567786.1|AW567786
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|5606615|gb|AI900713.1|AI900713
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGNGGTACNCT-GAACTACTTCNGGAAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTAC-CTTGAACTACTTCGGGAAACC
EST: gi|120531268|gb|EH259401.1|EH259401
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|19453008|gb|BM954418.1|BM954418
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|7283534|gb|AW596140.1|AW596140
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCCGGAAAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6071769|gb|AW101156.1|AW101156
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31463834|gb|CD405862.1|CD405862
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|15337851|gb|BI498507.1|BI498507
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC-
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|13479687|gb|BG509030.1|BG509030
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209718592|gb|BW662697.1|BW662697
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGTCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6134110|gb|AW132503.1|AW132503
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|15200139|gb|BI424193.1|BI424193
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|26268911|gb|CA819974.1|CA819974
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|5688183|gb|AI941198.1|AI941198
EST:     CCTTCAACACATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGTGGTACCTTGAACTACTTCGGG
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGG
EST: gi|209718591|gb|BW662696.1|BW662696
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGTCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGG
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGG
EST: gi|10843127|gb|BF067157.1|BF067157
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209720873|gb|BW662599.1|BW662599
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|23728211|gb|BU762151.1|BU762151
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31463641|gb|CD405669.1|CD405669
EST:     TTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: TTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213591516|gb|DB959946.1|DB959946
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGCACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|13788147|gb|BG650739.1|BG650739
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGTGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|23050476|gb|BU577005.1|BU577005
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|26268091|gb|CA819154.1|CA819154
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|10235177|gb|BE804065.1|BE804065
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGG-TACCTTGAACT-CTTCCGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|9902318|gb|BE611286.1|BE611286
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCATACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTGCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6134032|gb|AW132482.1|AW132482
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213607347|gb|DB957155.1|DB957155
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC-
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|120534112|gb|EH262245.1|EH262245
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|9820912|gb|BE556422.1|BE556422
EST:     CAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|7796165|gb|AW781562.1|AW781562
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|26057356|gb|CA800270.1|CA800270
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209722543|gb|BW682641.1|BW682641
EST:     GCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: GCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213619950|gb|DB976926.1|DB976926
EST:     CTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCGT-AGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC
genomic: CTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGC-TCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC
EST: gi|31458586|gb|CD400614.1|CD400614
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213596641|gb|DB977985.1|DB977985
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGCACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|120531346|gb|EH259479.1|EH259479
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|15200628|gb|BI424446.1|BI424446
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209698466|gb|BW667263.1|BW667263
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213591356|gb|DB973817.1|DB973817
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209722542|gb|BW682640.1|BW682640
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGAT
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGAT
EST: gi|7326544|gb|AW620342.1|AW620342
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTTCGG-AAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTT-CGGGAAACC
EST: gi|213610458|gb|DB958777.1|DB958777
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209705308|gb|BW667979.1|BW667979
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31311624|gb|CD396827.1|CD396827
EST:     AGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: AGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6134970|gb|AW133363.1|AW133363
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAAGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
EST: gi|10235347|gb|BE804235.1|BE804235
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAGACTGCGGTCCTGATGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGG
EST: gi|192309278|gb|FG999477.1|FG999477
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|298193915|gb|HO040563.1|HO040563
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCGAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|6134023|gb|AW132473.1|AW132473
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|7685853|gb|AW756501.1|AW756501
EST:     CTTCAACAAATATGGAGCANACTGCGGTCCTGATGCATGTT-GGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATTGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGC-TGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|120530617|gb|EH258750.1|EH258750
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|31458677|gb|CD400705.1|CD400705
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACCTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagA-CTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC
EST: gi|9205216|gb|BE331440.1|BE331440
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|214005712|gb|DB988665.1|DB988665
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGCTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|105633937|gb|DW247300.1|DW247300
EST:     CCTCCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGT
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGT
EST: gi|7326896|gb|AW620694.1|AW620694
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGG-TACCTT
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTT
EST: gi|15285047|gb|BI468938.1|BI468938
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|209725348|gb|BW658246.1|BW658246
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|20813024|gb|BQ297502.1|BQ297502
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|213596464|gb|DB960281.1|DB960281
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|5509200|gb|AI855758.1|AI855758
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTTCGG-AAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTT-CGGGAAACC
EST: gi|5677808|gb|AI938938.1|AI938938
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|15204669|gb|BI427437.1|BI427437
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCT
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCT
EST: gi|15285094|gb|BI468985.1|BI468985
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAG                         ACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACCC
EST: gi|5606982|gb|AI901080.1|AI901080
EST:     CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTTAAG                         ACTGGGAGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC
genomic: CCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagc ... atcgatgcagACTGG-AGCTCTGCTTCTTGATGGGGGTACCTTGAACTACTTCGGGAAACC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGTCCTGAGGCTGTTTGGTTCAAGgtttgcaagctttataacaactttcactgtgtcaagttcactaatacattatttttttatgacactcaacaaatgaaattcaatagatcttacaagtgct

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaatgaaa